Un patient du Connecticut a eu 471 jours de COVID, a développé 3 nouvelles lignées : étude

Un patient cancéreux du Connecticut a été infecté de manière chronique par le COVID-19 pendant au moins 471 jours consécutifs et a développé au moins trois lignées différentes du virus dans son sang pendant cette période, selon une nouvelle étude de chercheurs de Yale.

Le rapport met en évidence le potentiel des humains immunodéprimés à héberger l’évolution du COVID, alors que des scientifiques sud-africains ont émis l’hypothèse l’année dernière que la variante omicron pourrait provenir d’une personne souffrant d’une maladie chronique.

L’étude pré-imprimée non évaluée par des pairs a été menée par des scientifiques de Yale en collaboration avec des équipes d’Australie et de Caroline du Nord. Il était en ligne samedi.

https://www.nbcnewyork.com/news/coronavirus/top-ny-doctor-new-covid-wave-is-starting-with-the-worst-version-of-omicron/3752858/

Selon les auteurs, leur surveillance régulière des variantes de COVID a découvert une lignée connue sous le nom de B.1.517 dans le Connecticut, longtemps après qu’elle était largement invisible dans le monde. Le traçage ultérieur a ramené à une personne dans la soixantaine atteinte d’un lymphome.

Le patient a été testé positif au COVID pour la première fois en novembre 2020 et est resté positif au virus jusqu’en mars de cette année au moins.

« Le patient continue d’être testé positif pour le SRAS-CoV-2 pendant 471 jours et compte après le diagnostic initial », ont écrit les auteurs, ajoutant que la personne était contagieuse et avait essentiellement une charge virale élevée pendant toute la période. (Ils ont également noté que le patient avait des symptômes légers pendant quelques jours lors du premier diagnostic et qu’il allait bien depuis.)

Mais ce n’est pas seulement l’infection en cours qui a attiré leur attention, c’est le fait que le virus s’est rapidement développé chez le patient au fil du temps, créant trois nouvelles lignées distinctes.

En utilisant une analyse avancée des données des tests du patient et des bases de données mondiales, les auteurs ont conclu que le virus pourrait évoluer deux fois plus vite chez le patient que dans la population générale.

« Ces résultats montrent que cette infection chronique a entraîné une accélération du SRAS-CoV-2 »
évolution et divergence, un mécanisme qui peut contribuer à l’émergence de variantes génétiquement diverses du SRAS-CoV-2, notamment Omicron, Delta et Alpha », ont-ils écrit.

Parmi les variants qui se sont développés chez le patient, les auteurs ont ajouté : « (ces) différents génotypes semblaient apparaître dès les trois premiers mois de l’infection, bien que de nouveaux génotypes aient été détectés après près de dix mois, suggérant plusieurs génotypes. De nouveaux variants peuvent survenir se propager simultanément et potentiellement à partir du même individu immunodéprimé sur une période d’échantillonnage plus longue. »

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