Une nouvelle souche de bactéries résistantes aux antibiotiques circulant parmi les porcs tire la sonnette d’alarme après que les scientifiques ont découvert une caractéristique inquiétante du bogue.
Une nouvelle souche de bactéries résistantes aux antibiotiques circulant parmi les porcs tire la sonnette d’alarme quant à sa capacité à sauter sur les humains.
Une étude de l’Université de Cambridge a révélé que le « superbug » Staphylococcus aureus – résistant aux meilleurs antibiotiques de première ligne actuellement disponibles en médecine – a évolué au cours des 50 dernières années. Et c’est parce que les élevages de porcs en batterie à l’échelle industrielle ont dosé leur bétail pour freiner la propagation des maladies dans des conditions de surpeuplement.
La souche CC398 est la bactérie Staphylococcus aureus résistante à la méthicilline (SARM) dominante dans les porcheries européennes.
Il commence également à apparaître dans les infections humaines.
Et c’est une preuve alarmante qui soutient les craintes de l’Organisation mondiale de la santé que les infections résistantes aux médicaments n’explosent.
Le SARM est apparu pour la première fois chez l’homme en 1960. Les infections résistantes aux antibiotiques tuent aujourd’hui environ 750 000 personnes par an. D’ici 2050, l’OMS s’attend à ce que ce nombre passe à 10 millions.
Tout comme la pandémie de COVID-19 a comblé les pires craintes de l’OMS concernant la « maladie X », la communauté médicale mondiale est à l’affût d’un fléau résistant aux antibiotiques presque inévitable.
CC398 ne l’est pas.
Mais il peut contenir les blocs de construction pour un.
« Les cas de SARM liés au bétail chez l’homme ne représentent encore qu’une petite fraction de tous les cas de SARM dans les populations humaines, mais le fait qu’ils augmentent est un signe inquiétant », a déclaré l’auteur principal de l’étude, le Dr. Luxy Weinert.
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Avertissements ignorés
Pendant des décennies, les scientifiques ont mis en garde les industries allant des usines de poulet aux fermes piscicoles contre les dangers de l’administration d’antibiotiques de qualité humaine à leurs animaux.
« Nous avons constaté que la résistance aux antibiotiques de ce SARM lié au bétail est extrêmement stable – elle existe depuis des décennies, et aussi parce que la bactérie s’est propagée à différentes espèces de bétail », ajoute le Dr. Gemma Murray.
Les conclusions ont été publiées dans le magazine eLife.
CC398 se trouve le plus souvent chez les porcs. Des étables au Danemark ont récemment signalé que 90 % de leur bétail était infecté.
Les porcs ne développent pas de symptômes.
Mais il montre maintenant une capacité à prospérer chez l’homme.
Et une fois qu’il comble le fossé entre les espèces, il a été observé qu’il conserve sa capacité à rejeter les médicaments.
Une capacité similaire a récemment été découverte chez une autre superbactérie du bétail – clostridioides.
Il vit également parmi les porcs et montre des signes de développement de la capacité de sauter sur les humains.
« Cette découverte alarmante suggère que la résistance aux antibiotiques pourrait se propager plus largement qu’on ne le pensait auparavant, confirmant les liens de la chaîne de résistance qui va des animaux de ferme aux humains », a déclaré Semeh Bejaoui, chercheur à l’Université de Copenhague.
Efficacité vs résilience
L’agriculture à haute intensité est une question controversée.
D’une part, c’est un moyen efficace de produire en masse de la viande ordinaire et des aliments pour animaux.
D’un autre côté, il y a longtemps que des scandales entourent le bien-être animal et la propagation des maladies.
Elle est aujourd’hui devenue une préoccupation internationale majeure en tant que « réservoir » d’antibiotiques et d’infections virales.
Et les lignes d’approvisionnement internationales associées à la baisse de la diversité génétique ne font qu’ajouter au risque d’une épidémie ultra-rapide.
Le mécanisme génétique exact derrière une telle adaptation bactérienne commence à être compris.
Les chercheurs de Cambridge ont identifié trois éléments génétiques « mobiles » au sein du CC398 qui contiennent des blocs de données génétiques sur la résistance aux antibiotiques. Être « mobile » signifie que ces paquets génétiques peuvent être échangés entre des bactéries d’espèces différentes.
Deux éléments génétiques – Tn916 et SCCmec – ont des instructions pour échapper aux antibiotiques.
L’un – φSa3 – donne à CC398 les plans pour échapper au système immunitaire humain.
Et φSa3 est apparu et a disparu à plusieurs reprises au fil du temps, ce qui suggère que la bactérie peut s’adapter rapidement aux hôtes humains.
« Comprendre l’émergence et le succès du CC398 dans le bétail européen – et sa capacité à infecter les humains – est essentiel pour gérer le risque qu’il représente pour la santé publique », a déclaré le Dr Weinert.
L’Europe a interdit l’utilisation de l’oxyde de zinc dans les porcheries ce mois-ci. Il était souvent utilisé pour traiter la diarrhée chez les porcelets.
Mais c’est trop peu, trop tard, avertissent les chercheurs : « Cette interdiction pourrait ne pas contribuer à réduire la prévalence du CC398 car les gènes conférant la résistance aux antibiotiques ne sont pas toujours liés aux gènes conférant la résistance au traitement au zinc. »
Conséquences dévastatrices
Une épidémie de maladie entre 2018 et 2020 a tué la moitié des porcs chinois.
C’est des millions d’animaux.
La grippe porcine africaine a provoqué de la fièvre, une perte d’appétit et des hémorragies internes. Finalement, les organes internes des porcs s’effondrent. Un effort pour contenir l’épidémie a conduit à un abattage à l’échelle de l’industrie, au cours duquel des millions de porcs ont été abattus et enterrés.
Les prix du porc ont augmenté à mesure que les pénuries devenaient monnaie courante. Les analystes internationaux estiment que l’impact économique total de la grippe porcine africaine représentait plus de 1 % du PIB de la Chine.
La propagation initiale de l’Afrique à Lisbonne en 1957 s’est avérée avoir été causée par des sandwichs au jambon jetés par les compagnies aériennes et nourris aux porcs.
Le virus a depuis fait du stop dans le monde entier, transporté dans les exportations commerciales vivantes et les produits congelés.
Elle est désormais ancrée en Europe et en Asie. Il a récemment été trouvé en Haïti et en République dominicaine dans les Caraïbes.
L’Australie a déclaré qu’elle constituait une menace importante pour la biosécurité de l’industrie porcine locale.
Jusqu’à présent, le virus n’a montré aucun signe de passage à l’homme. Mais les maladies porcines – telles que les maladies des oiseaux – ont une longue histoire de trouver des moyens de faire le saut.
Jamie Seidel est un écrivain indépendant. † @JamieSeidel
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