Monkeypox a muté à un rythme sans précédent avec une « évolution accélérée »

Les chercheurs qui étudient la constitution génétique du virus monkeypox ont déclaré que le virus semble avoir muté beaucoup plus que ce à quoi on pourrait normalement s’attendre.

Les travaux sont décrits dans une nouvelle étude publiée dans la revue la naturopathie† Dans le cadre de l’étude, des chercheurs portugais ont collecté un total de 15 séquences de virus monkeypox – principalement du Portugal – et ont reconstruit leurs données génétiques.

La variole du singe est une maladie rare dont on pense qu’elle trouve son origine chez les animaux. Il provient de la même famille de virus que la variole. Le plus souvent, la variole du singe a été localisée dans les pays d’Afrique occidentale et centrale, mais cette année, la première épidémie s’est produite dans plusieurs pays, y compris des cas sans lien connu avec l’Afrique occidentale ou centrale, avec plus de 3 500 cas signalés jeudi, selon les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis.

Le virus peut être transmis entre les personnes par contact étroit avec des lésions, des fluides corporels, des gouttelettes respiratoires – par exemple par contact personnel – et des matériaux contaminés. L’épidémie actuelle a conduit à une incertitude quant à la manière exacte dont le virus se propage, avec une transmission beaucoup plus importante que d’habitude.

Dans la dernière étude, les chercheurs ont découvert environ 50 variations génétiques dans les virus qu’ils ont étudiés par rapport à ceux de 2018 et 2019. Ceci, ont-ils dit, « est bien plus que ce à quoi vous pourriez vous attendre compte tenu des estimations précédentes » du taux de mutation des orthopoxvirus dont le monkeypox est un type – entre six et douze fois plus.

Ces variations génétiques importantes peuvent indiquer une « évolution accélérée ».

stock de variole du singe
Stock image représentant la variole du singe. Les chercheurs ont découvert une « évolution accélérée » dans la dernière souche de monkeypox qui a déclenché une épidémie dans plusieurs pays non endémiques.
Getty Images

« Nos données révèlent des preuves supplémentaires d’une évolution virale continue et d’une éventuelle adaptation humaine », a écrit l’équipe, ajoutant qu’elle avait identifié des protéines connues pour interagir avec le système immunitaire humain. Cependant, d’autres études seront nécessaires pour en savoir plus sur le rôle potentiel qu’elles pourraient jouer dans l’adaptation du virus monkeypox à la propagation à l’homme.

João Paulo Gomes, chef de l’unité de génomique et de bioinformatique à l’Institut national de la santé au Portugal, co-auteur de l’étude, a déclaré qu’on ne sait pas si les mutations ont contribué à une transmissibilité accrue entre les humains.

« Nous ne savons pas », a-t-il dit semaine de nouvelles† « Tout ce que nous savons, c’est que ces 50 mutations supplémentaires étaient assez inattendues.

« Étant donné que ce virus monkeypox en 2022 est probablement un descendant du virus lors de l’épidémie au Nigeria en 2017, vous ne vous attendez pas à plus de cinq à dix mutations supplémentaires au lieu des quelque 50 mutations observées. Nous espérons que des groupes spécialisés mèneront désormais des analyses de laboratoire des expériences pour comprendre si ce virus de 2022 a augmenté sa transmissibilité. »

Une autre découverte notable de l’étude est que la plupart des mutations sont d’un type qui aurait pu être introduit par un mécanisme de défense humain appelé APOBEC3, qui fonctionne en introduisant des mutations dans les virus pour les empêcher de fonctionner correctement, a déclaré Pam Vallely, professeur de virologie médicale. à l’Université de Manchester.

« Dans ce cas, cependant, les mutations ne rendent apparemment pas le virus invivable et pourraient potentiellement l’aider à s’adapter à la transmission interhumaine », a déclaré Vallely, qui n’a pas participé à l’étude. semaine de nouvelles† « Ce n’est qu’une théorie qui correspond aux preuves actuelles, et beaucoup plus de travail sera nécessaire pour voir si c’est vraiment ce qui se passe. Je ne pense pas que nous puissions dire que les mutations l’ont rendu plus contagieux, mais peut-être qu’ils se sont adaptés c’est mieux pour les humains. »

Les chercheurs affirment que leurs travaux montrent que le séquençage du génome viral du monkeypox peut être suffisamment précis pour suivre la propagation de l’épidémie actuelle et voir comment la transmission pourrait changer. Ceci, à son tour, permettrait aux décideurs de prendre des mesures pour freiner la propagation du monkeypox. Les vaccins sont déjà disponibles.

Particules du virus Monkeypox
Particules du virus Monkeypox vues sur une image au microscope, publiée le 6 juin 2022. Des milliers de cas ont été signalés cette année dans le cadre d’une épidémie mondiale.
CDC/Orfèvre/Collection Smith/Gado/Getty

Jeremy Kamil, professeur agrégé de microbiologie et d’immunologie à la Louisiana State University Health Shreveport, a déclaré : semaine de nouvelles l’étude décrite comme « très impressionnante », mais a déclaré qu’il était trop tôt pour dire avec certitude si la variole du singe évolue rapidement jusqu’à ce que nous puissions exclure la possibilité que le virus circule chez l’homme et s’adapte « plus longtemps que les humains ne le supposent – peut-être en commençant par un sous-échantillon régions du monde, telles que certaines parties de l’Afrique où la variole du singe est endémique. »

Alex Sigal, virologue à l’Institut africain de recherche en santé (AHRI) et professeur agrégé à l’Université du KwaZulu-Natal, qui n’a pas non plus participé à l’étude, a fait écho au point de Kamil.

« Je pense que cette épidémie était sous le radar pendant un certain temps », a-t-il déclaré semaine de nouvelles† « Certes, la baisse de l’immunité parce que le vaccin contre la variole n’est plus administré aurait pu aider.

†[The findings are] inquiétant, mais nous verrons si ce virus continue de se propager une fois que les gens auront pris conscience des signes et qu’il éclatera dans la population générale. Cela dépend du contact, et à moins que la propagation ne se fasse par les voies respiratoires, il devrait être plus facile de l’arrêter. »

Les efforts de séquençage des virus ont également confirmé que les virus étudiés appartenaient à un type spécifique de virus monkeypox connu sous le nom de clade 3, confirmant qu’ils font partie du type ouest-africain plus large par opposition au type centrafricain.

La version ouest-africaine du monkeypox, qui a généralement un taux de mortalité inférieur à 1%, est beaucoup moins virulente que la version centrafricaine du clade 1, qui peut entraîner la mort dans plus de 10% des cas, selon l’étude.

Mise à jour, 24/06/22, 06h13 HE : Cet article a été mis à jour pour inclure les numéros de cas de variole du singe les plus récents.

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