Omicron a-t-il évolué pour devenir plus dangereux ?

Réponse courte : probablement pas.

Réponse plus longue : probablement pas, et même si c’est le cas, ce n’est peut-être pas assez dangereux pour faire du mal, compte tenu de l’immunité dont la population dispose désormais.

J’ai écrit il y a quelques semaines sur les nouvelles sous-variantes d’Omicron, BA.4 et BA.5. Les premières indications sont qu’ils sont plus contagieux que la sous-variante dominante actuelle aux États-Unis, BA.2.12.1, qui est plus contagieuse que l’Omicron original, qui lui-même était incroyablement contagieux. Pire, parce que l’immunité naturelle d’Omicron ne semble durer que quelques mois, une infection antérieure n’est pas une véritable défense contre BA.4 et BA.5. En fait, les deux sont si immunisés qu’ils peuvent percer l’immunité même chez quelqu’un qui a eu une infection récente.

L’essentiel est qu’à l’ère d’Omicron, les gens contracteront le COVID encore et encore. Il n’y a pas non plus de perspective à court terme d’un vaccin qui pourrait empêcher cela : alors que les vaccins à ARNm offrent une excellente immunité contre les maladies graves, un vaccin qui conférera une immunité contre l’infection, comme le vaccin contre la variole, semble être une issue.

Nous sommes donc tous destinés à attraper éventuellement une sous-variante d’Omicron. Dans ce cas, il est important de savoir si ces sous-variantes deviennent plus virulentes.

Vous vous souviendrez peut-être qu’après l’apparition d’Omicron en Afrique l’hiver dernier, les scientifiques ont tenté de comprendre pourquoi les personnes infectées semblaient présenter des symptômes plus légers qu’avec les souches de coronavirus précédentes. La réponse, selon certains chercheurs, avait à voir avec l’endroit où le virus a pris racine dans le corps. Des souches antérieures se sont reproduites dans les poumons, provoquant la pneumonie mortelle qui a tué des millions de personnes. Cependant, Omicron ne s’est pas reproduit efficacement dans les poumons. Il s’est reproduit dans les voies respiratoires supérieures. Parce qu’il n’affecte pas les organes principaux, plus de gens ont pu s’en débarrasser sans dommage grave.

Des chercheurs au Japon disent avoir des preuves que BA.4 et BA.5 se propagent mieux dans les poumons que leurs grands-parents.

Selon les données préliminaires de Kei Sato de l’Université de Tokyo et ses collègues, BA.4, BA.5 et BA.2.12.1 peuvent avoir évolué pour favoriser l’infection des cellules pulmonaires, plutôt que des tissus des voies respiratoires supérieures, les faisant apparaître davantage sur variantes antérieures, comme Alpha ou Delta…

Les expériences du professeur Sato indiquent que BA.4, BA.5 et BA.2.12.1 se répliquent plus efficacement dans les cellules pulmonaires humaines que BA.2, tandis que d’autres expériences sur des hamsters suggèrent que BA.4 et BA.5 peuvent provoquer des maladies plus graves.

« Il semble que ces choses reviennent à la forme d’infection la plus dangereuse, donc plus bas dans les poumons », a déclaré le Dr. Stephen Griffin, virologue à l’Université de Leeds.

Jeu terminé, mec. Le jeu est fini.

Ou est-ce? Regardons quelques chiffres. Selon ce site, BA.4 et BA.5 représentent une majorité significative de cas au cours des 60 derniers jours en Afrique du Sud, le pays le plus durement touché par les nouvelles sous-variantes. Au cours des 60 derniers jours, BA.4 représentait 63% des cas confirmés, tandis que BA.5 représentait 20% de plus. Soixante jours, c’est aussi beaucoup de temps pour qu’une vague de décès apparaisse dans les données, car la période typique entre l’infection et le décès par COVID est d’environ un mois. Avons-nous récemment assisté à un pic de décès en Afrique du Sud en raison de la prévalence inquiétante de BA.4 et BA.5 ?

Nous ne faisons pas:

Le chercheur sud-africain Tulio de Oliveira, qui a sonné l’alarme mondiale sur Omicron l’année dernière, rapporte que les vagues BA.4 et BA.5 sont les vagues les moins meurtrières que le pays ait connues à ce jour.

Il est plus difficile de tirer des conclusions définitives sur les États-Unis et le Royaume-Uni, car BA.4 et BA.5 ne sont pas encore dominants ou ne l’ont pas été assez longtemps pour nous permettre de tirer une conclusion sur la façon dont ils peuvent être mortels. Les scientifiques en Angleterre pensent que les deux sous-variantes se propagent rapidement là-bas, probablement alimentées par les récentes célébrations de l’anniversaire de la reine Elizabeth. Les cas ont augmenté de plus de 30% au cours des sept derniers jours – tout comme les hospitalisations, en particulier. C’est une preuve circonstancielle intéressante qu’il y a quelque chose dans les données japonaises sur une plus grande virulence. Mais combien plus grand ? Voici à quoi ressemble la courbe de la mort :

Il se pourrait que bon nombre des personnes récemment hospitalisées meurent au cours des deux prochaines semaines, poussant la courbe vers le haut, mais rien ne prouve encore que la vague que connaît actuellement l’Angleterre soit particulièrement meurtrière. C’est peut-être parce que BA.4 et BA.5 ne sont pas aussi virulents qu’on le craignait, mais il se pourrait aussi que la médecine ait rattrapé le virus et transformé des cas de COVID qui auraient été mortels il y a un an en courts séjours à l’hôpital. Combinez l’immunité élargie de la population avec de meilleures thérapies telles que Paxlovid et une base de connaissances beaucoup plus large parmi les médecins et les infirmières sur la façon de traiter la maladie aux urgences et même une sous-variante virulente peut ne pas être aussi virulente dans la pratique. Les deux sous-variantes peuvent être suffisamment dangereuses pour vous envoyer à l’hôpital plus souvent qu’Omicron, mais peuvent ne pas être suffisamment dangereuses pour vous envoyer à la morgue. Du moins pas à ce stade de la pandémie.

Un autre aperçu des données. Jetez un autre coup d’œil à l’extrait ci-dessus et vous verrez que des chercheurs japonais ont découvert que BA.2.12.1, et pas seulement BA.4 et BA.5, semble se reproduire plus efficacement dans les poumons que l’Omicron d’origine. Eh bien, selon le CDC, il y a eu beaucoup de BA.2.12.1 aux États-Unis depuis début mai :

Nous avons connu le même phénomène qu’en Angleterre pendant ces six semaines, avec non seulement une augmentation des cas, mais aussi des hospitalisations. En fait, le nombre de personnes hospitalisées avec COVID est maintenant le double de ce qu’il était à la mi-avril, preuve plus circonstancielle que les sous-variantes d’Omicron sont vraiment plus virulentes. Mais que voit-on quand on regarde la courbe de la mort ?

Pas de pic. Selon Drudge, nous avons eu moins de décès dus au COVID hier (293) qu’à la même date il y a un an (301), même si nous avons eu près de * neuf fois * plus de cas confirmés – et probablement beaucoup plus de fois qu’en réalité, si nous pourrions inclure toutes les personnes qui ont été testées positives hier sur des tests rapides, mais qui n’ont jamais pris la peine de confirmer leur infection avec un laboratoire. Même à l’ère des sous-variantes d’Omicron, le virus tue beaucoup moins de personnes en pourcentage d’infections qu’auparavant. Il n’y a pas encore de bonne raison de penser que BA.4 et BA.5 sont particulièrement menaçants.

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