La fièvre typhoïde est peut-être rare dans les pays développés, mais cette ancienne menace, dont on pense qu’elle existe depuis des millénaires, est toujours une menace majeure dans notre monde moderne.
Selon de nouvelles recherches, la bactérie qui cause la fièvre typhoïde développe une résistance étendue aux médicaments et remplace rapidement les souches qui ne sont pas résistantes.
Actuellement, les antibiotiques sont le seul moyen de traiter efficacement la fièvre typhoïde, qui est causée par la bactérie Salmonella enterica sérotype Typhi (S Typhi). Mais au cours des trois dernières décennies, la résistance de la bactérie aux antibiotiques oraux a augmenté et s’est propagée.
Lors du séquençage des génomes de 3 489 souches de S Typhi contractées au Népal, au Bangladesh, au Pakistan et en Inde entre 2014 et 2019, les chercheurs ont découvert une augmentation récente de Typhi extrêmement résistant aux médicaments (XDR).
XDR Typhi est non seulement résistant aux antibiotiques de première intention, tels que l’ampicilline, le chloramphénicol et le triméthoprime/sulfaméthoxazole, mais il devient également résistant aux antibiotiques plus récents, tels que les fluoroquinolones et les céphalosporines de troisième génération.
Pire, ces espèces se répandent rapidement dans le monde entier.
Bien que la plupart des cas de XDR Typhi proviennent d’Asie du Sud, les chercheurs ont identifié près de 200 cas de propagation internationale depuis 1990.
La plupart des espèces ont été exportées vers l’Asie du Sud-Est, ainsi que vers l’Afrique de l’Est et du Sud, mais des superbactéries typhoïdes ont également été trouvées au Royaume-Uni, aux États-Unis et au Canada.
« La vitesse à laquelle des souches de S. Typhi hautement résistantes ont émergé et se sont propagées ces dernières années est une véritable source d’inquiétude et souligne la nécessité d’étendre d’urgence les mesures de prévention, en particulier dans les pays les plus à risque », explique l’infectiologue Jason. Andrews de l’Université de Stanford.
Les scientifiques mettent en garde contre le typhus résistant aux médicaments depuis des années, mais la nouvelle recherche est la plus grande analyse du génome de la bactérie à ce jour.
En 2016, la première souche typhoïde XDR a été identifiée au Pakistan. En 2019, il était devenu le génotype dominant dans le pays.
Historiquement, la plupart des souches XDR de typhoïde ont été contrôlées avec des antimicrobiens de troisième génération tels que les quinolones, les céphalosporines et les macrolides.
Mais au début des années 2000, les mutations conférant une résistance aux quinolones représentaient plus de 85 % de tous les cas au Bangladesh, en Inde, au Pakistan, au Népal et à Singapour. Dans le même temps, la résistance aux céphalosporines a également pris le dessus.
Il ne reste aujourd’hui qu’un seul antibiotique oral : le macrolide, l’azithromycine. Et ce médicament peut ne pas fonctionner longtemps.
La nouvelle étude a révélé que les mutations conférant une résistance à l’azithromycine se propagent désormais également, « menaçant l’efficacité de tous les antimicrobiens oraux pour le traitement de la fièvre typhoïde ». Bien que ces mutations n’aient pas encore été adoptées par XDR S Typhi, nous avons de sérieux problèmes si elles le sont.
En l’absence de traitement, jusqu’à 20 % des cas de typhoïde peuvent être mortels, et aujourd’hui, il y a 11 millions de cas de typhoïde par an.
Les futures épidémies pourraient être évitées dans une certaine mesure grâce aux vaccins conjugués contre la typhoïde, mais si l’accès à ces injections n’est pas étendu à l’échelle mondiale, le monde pourrait bientôt faire face à une autre crise sanitaire.
« L’émergence récente de XDR et de S Typhi résistant à l’azithromycine crée une plus grande urgence pour l’expansion rapide des mesures de prévention, y compris l’utilisation de vaccins conjugués contre la typhoïde dans les pays endémiques de la typhoïde », écrivent les auteurs.
« De telles mesures sont nécessaires dans les pays où la prévalence de la résistance aux antimicrobiens parmi les isolats de S Typhi est actuellement élevée, mais étant donné la propension à la propagation internationale, elles ne devraient pas être limitées à ces paramètres. »
L’Asie du Sud est peut-être la principale plaque tournante de la fièvre typhoïde, représentant 70% de tous les cas, mais si COVID-19 nous a appris quelque chose, c’est que les variantes de la maladie se propagent facilement dans notre monde moderne et globalisé.
Pour éviter cela, les experts de la santé soutiennent que les pays devraient élargir l’accès aux vaccins contre la typhoïde et investir dans de nouvelles recherches sur les antibiotiques. Par exemple, une étude récente en Inde estime que la vaccination des enfants des zones urbaines contre la typhoïde pourrait prévenir jusqu’à 36 % des cas et des décès liés à la typhoïde.
Le Pakistan montre actuellement la voie sur ce front. C’est le premier pays au monde à proposer une vaccination systématique contre la fièvre typhoïde. L’année dernière, des millions d’enfants ont reçu le vaccin et les experts de la santé affirment que davantage de pays devraient emboîter le pas.
La résistance aux antibiotiques est l’une des principales causes de décès dans le monde, faisant plus de victimes que le VIH/sida ou le paludisme. Lorsqu’ils sont disponibles, les vaccins sont parmi les meilleurs outils dont nous disposons pour prévenir de futures catastrophes.
On n’a pas de temps à perdre.
L’étude est publiée dans Le microbe lancette†
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